เอ็มเทคกำหนดกลุ่มเป้าหมายการใช้ประโยชน์จากผลผลิตงานวิจัย เป็น 5 กลุ่มหลัก ได้แก่
1. อุตสาหกรรมการผลิตและบริการทางวิศวกรรม 
2. ความปลอดภัยและคุณภาพชีวิต 
3. สุขภาพและความเป็นอยู่ที่ดี 
4. อุตสาหกรรมฐานเกษตรกรรม 
5. เกษตรกรรม
นอกจากนี้ยังมีกลุ่มเทคโนโลยเป้าหมายอีก 1 กลุ่ม คือ พลังงาน